Собрать банк: цифровая «БиоВитрина» поможет тестировать лекарства от рака
В России заработал веб-ресурс «БиоВитрина» — это база данных с информацией о биологических образцах — тканях, плазме, сыворотке крови — людей с различными, в основном онкологическими, диагнозами. Сайт поможет в изучении фундаментальных принципов возникновения рака и исследовании новых лекарств без лишних затрат времени и денег на поиск подходящего испытуемого. Полезен портал и самим пациентам — на нем у каждого донора биологического образца есть личный кабинет с доступом к результатам исследований. Лечащий врач донора сможет использовать эти данные для подбора наиболее эффективной терапии.
База сданных
В Научном центре мирового уровня (НЦМУ) «Цифровой биодизайн и персонализированное здравоохранение» создали уникальный медицинский веб-ресурс «БиоВитрина». Это база данных, в которой хранится информация о биологических материалах людей с тем или иным установленным диагнозом. Речь об образцах плазмы и сыворотки крови, тканей и мочи, расшифровках тех или иных анализов.
Как пояснили «Известиям» разработчики, в настоящее время большая часть образцов получена от доноров с онкологическими заболеваниями. Создание платформы «БиоВитрина» началось в 2021 году. Перед учеными стояла задача разработать прототип продукта и программного решения.
— Мы старались максимально учесть пожелания как свои, так и наших коллег, чтобы разработка была удобной и, самое главное, востребованной. Мы не ожидали, что такой, на первый взгляд, простой продукт, как веб-репозиторий биологических образцов, может быть полезен не только ученым, но и нашим клиническим партнерам, то есть врачам, а также донорам образцов, то есть пациентам, — рассказала «Известиям» младший научный сотрудник НЦМУ «Цифровой биодизайн и персонализированное здравоохранение» Анастасия Букреева.
Платформа доступна, и на ней уже зарегистрированы первые пользователи. База данных основана на репозитории Института биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича (ИБМХ). Туда образцы крови, мочи и тканей пациентов с их задокументированного согласия попадают из клинических центров. Это Институт урологии и репродуктивного здоровья человека Сеченовского университета, Психиатрическая клиническая больница № 1 им. Н.А. Алексеева и многие другие заведения здравоохранения.
Образцы будут использовать для проведения фундаментальных научных исследований в области биомедицины для выявления молекулярно-клеточных механизмов развития заболевания, в частности рака, рассказали разработчики. Также с помощью такого удобного инструмента специалисты получают возможность тестировать те или иные лекарства и терапевтические подходы на конкретных биоматериалах. Ресурс существенно сокращает время и деньги на поиск подходящих доноров.
Объединить все звенья
Идея «БиоВитрины» заключается в обратной связи между учеными, врачами и исследователями — пользователями платформы. Они могут не только обмениваться данными, но и дополнять их новыми результатами, находить соратников в решении научной проблемы.
— Каждый исследователь сталкивается с потребностью получения клинических образцов. Это вынуждает их заниматься поиском медицинских партнеров, согласованием всех юридических аспектов сотрудничества. Нередко за этим также стоит задача выделения финансирования на получение образцов. Всё это усложняет проведение экспериментальных работ, а самое главное, расходует главный ресурс экспериментатора — время, — пояснила Анастасия Букреева.
Наличие «БиоВитрины» позволяет исследователям намного быстрее создавать выборку для экспериментов, а наличие образцов повышает ценность научных результатов, рассказала она. Кроме того, наличие в системе результатов проведенных над образцами экспериментов (например, результаты масс-спектрометрии) дает возможность избежать «двойной работы» и сэкономить два наиболее важных ресурса в научной работе — время и деньги.
Также на портале есть сервис личного кабинета донора биологического образца. Человек получает доступ к результатам исследований, которые проводятся с использованием его тканей, плазмы, сыворотки крови. Эти данные могут быть использованы лечащим врачом для подбора наиболее эффективной терапии.
Перспективное хранилище
Необходимое условие для получения доступа к порталу — последующая публикация результатов экспериментальных исследований на «БиоВитрине». Так сохраняется уникальность полученных данных и использованных образцов. Создатели очень надеются, что продукт будет востребован не только в области биомедицины, для которой его подготовили, но и в сельском хозяйстве, фармакологии.
Подобные цифровые платформы и веб-репозитории — важный инструмент как для исследователей, так и для клиницистов, сообщил «Известиям» директор Научно-технологического парка биомедицины Сеченовского университета Петр Тимашев.
— Их цель — оптимизация взаимодействия клинических и научно-исследовательских центров для плодотворного сотрудничества в разработке новых методов диагностики и терапии широкого спектра заболеваний. Подобные платформы призваны революционизировать здравоохранение, способствуя развитию персонализированной медицины, — подчеркнул он.
Биобанки в принципе имеют несколько целей, рассказал заведующий лабораторией анализа показателей здоровья населения и цифровизации здравоохранения МФТИ Станислав Отставнов. С одной стороны, это сохранение биоразнообразия, с другой — коллекция эталонов для биотехнологических производств.
— Грамотная организация позволит избежать ситуации, когда в ходе работы исследователей или производственников что-то уникальное будет утеряно без возможности восстановления. Здесь идет речь о веб-репозитории, и значит, исследователи смогут изучать и экспериментировать с теми образцами, с которыми нужно это делать, точнее с их моделями, без риска утери образцов, — рассказал он.
«БиоВитрина» создана в рамках национального проекта «Наука и университеты».
